Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms