Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC166P0CW27 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms