Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms