Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFMP07197 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFMP07197 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFMP07197 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFMP07197 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFMP07197 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFMP07197 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFMP07197 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFMP07197 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFMP07197 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFMP07197 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFMP07197 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFMP07197 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFMP07197 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFMP07197 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFMP07197 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFMP07197 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFMP07197 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFMP07197 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFMP07197 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFMP07197 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFMP07197 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFMP07197 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFMP07197 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFMP07197 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFMP07197 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFMP07197 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFMP07197 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFMP07197 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms