Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYF2O95926 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYF2O95926 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYF2O95926 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYF2O95926 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYF2O95926 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYF2O95926 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYF2O95926 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYF2O95926 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYF2O95926 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYF2O95926 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYF2O95926 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYF2O95926 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYF2O95926 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYF2O95926 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYF2O95926 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYF2O95926 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYF2O95926 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYF2O95926 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYF2O95926 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYF2O95926 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYF2O95926 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYF2O95926 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYF2O95926 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYF2O95926 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYF2O95926 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYF2O95926 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYF2O95926 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYF2O95926 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms