Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMUO75648 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRMUO75648 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRMUO75648 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRMUO75648 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMUO75648 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMUO75648 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMUO75648 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMUO75648 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMUO75648 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMUO75648 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMUO75648 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMUO75648 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMUO75648 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMUO75648 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMUO75648 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms