Protein–RNA interactions for Protein: O75581

LRP6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP6O75581 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP6O75581 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP6O75581 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP6O75581 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP6O75581 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP6O75581 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP6O75581 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP6O75581 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP6O75581 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP6O75581 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP6O75581 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP6O75581 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP6O75581 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP6O75581 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP6O75581 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP6O75581 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP6O75581 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP6O75581 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP6O75581 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP6O75581 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP6O75581 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP6O75581 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP6O75581 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP6O75581 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP6O75581 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP6O75581 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP6O75581 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP6O75581 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP6O75581 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP6O75581 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP6O75581 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP6O75581 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP6O75581 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP6O75581 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP6O75581 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP6O75581 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP6O75581 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP6O75581 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP6O75581 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP6O75581 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP6O75581 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP6O75581 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP6O75581 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP6O75581 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP6O75581 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP6O75581 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP6O75581 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms