Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPATO15228 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPATO15228 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPATO15228 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPATO15228 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPATO15228 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPATO15228 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPATO15228 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPATO15228 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GNPATO15228 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GNPATO15228 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GNPATO15228 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GNPATO15228 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GNPATO15228 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GNPATO15228 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GNPATO15228 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GNPATO15228 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPATO15228 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPATO15228 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPATO15228 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPATO15228 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPATO15228 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPATO15228 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPATO15228 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPATO15228 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPATO15228 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPATO15228 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPATO15228 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPATO15228 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPATO15228 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPATO15228 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPATO15228 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPATO15228 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPATO15228 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPATO15228 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPATO15228 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPATO15228 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPATO15228 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPATO15228 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPATO15228 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPATO15228 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPATO15228 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPATO15228 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPATO15228 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPATO15228 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPATO15228 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPATO15228 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPATO15228 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPATO15228 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPATO15228 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPATO15228 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPATO15228 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPATO15228 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPATO15228 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPATO15228 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPATO15228 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPATO15228 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPATO15228 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPATO15228 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPATO15228 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPATO15228 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPATO15228 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNPATO15228 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNPATO15228 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNPATO15228 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNPATO15228 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNPATO15228 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNPATO15228 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNPATO15228 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GNPATO15228 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms