Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLGNO14967 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLGNO14967 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLGNO14967 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CLGNO14967 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLGNO14967 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLGNO14967 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLGNO14967 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms