Protein–RNA interactions for Protein: O14558

HSPB6, Heat shock protein beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB6O14558 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HSPB6O14558 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB6O14558 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB6O14558 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB6O14558 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB6O14558 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB6O14558 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB6O14558 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HSPB6O14558 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB6O14558 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB6O14558 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB6O14558 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB6O14558 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB6O14558 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB6O14558 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB6O14558 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB6O14558 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB6O14558 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB6O14558 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB6O14558 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB6O14558 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB6O14558 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB6O14558 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms