Protein–RNA interactions for Protein: O00189

AP4M1, AP-4 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4M1O00189 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AP4M1O00189 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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AP4M1O00189 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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AP4M1O00189 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP4M1O00189 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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