Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP23O00161 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP23O00161 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP23O00161 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP23O00161 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP23O00161 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP23O00161 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP23O00161 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP23O00161 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP23O00161 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP23O00161 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP23O00161 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP23O00161 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP23O00161 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SNAP23O00161 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP23O00161 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms