Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA8SH3BPF8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GOLGA8SH3BPF8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA8SH3BPF8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA8SH3BPF8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA8SH3BPF8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA8SH3BPF8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA8SH3BPF8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA8SH3BPF8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA8SH3BPF8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA8SH3BPF8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA8SH3BPF8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA8SH3BPF8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA8SH3BPF8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA8SH3BPF8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA8SH3BPF8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA8SH3BPF8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA8SH3BPF8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA8SH3BPF8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA8SH3BPF8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms