Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms