Protein–RNA interactions for Protein: A4D1E1

ZNF804B, Zinc finger protein 804B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF804BA4D1E1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF804BA4D1E1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF804BA4D1E1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms