Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms