Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms