Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms