Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHKBQ9Y259 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms