Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms