Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms