Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms