Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms