Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms