Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYH13Q9UKX3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms