Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms