Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms