Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms