Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms