Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20BQ9P0W2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms