Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms