Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms