Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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