Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms