Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms