Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms