Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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CTDSP1Q9GZU7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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CTDSP1Q9GZU7 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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CTDSP1Q9GZU7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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CTDSP1Q9GZU7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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