Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC11Q9BVV2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms