Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms