Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
C1orf50Q9BV19 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf50Q9BV19 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf50Q9BV19 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf50Q9BV19 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf50Q9BV19 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf50Q9BV19 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf50Q9BV19 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf50Q9BV19 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf50Q9BV19 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf50Q9BV19 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf50Q9BV19 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf50Q9BV19 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf50Q9BV19 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf50Q9BV19 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf50Q9BV19 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf50Q9BV19 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf50Q9BV19 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf50Q9BV19 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf50Q9BV19 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf50Q9BV19 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf50Q9BV19 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf50Q9BV19 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf50Q9BV19 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf50Q9BV19 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms