Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP23Q9BRU9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.3 ms