Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms