Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms