Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YTHDC1Q96MU7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms