Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms