Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms