Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRF4Q8WWF5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms