Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVE6

TMEM171, Transmembrane protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM171Q8WVE6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms