Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms