Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms